Pytanie:
How are non-carbon stereogenic centers named (S/R)?
F'x
2012-05-18 15:55:37 UTC
view on stackexchange narkive permalink

System nazewnictwa R / S dla stereocentrów opiera się na regułach pierwszeństwa Cahna-Ingolda-Preloga, aby uszeregować cztery podstawniki w stereocentrum; nazwa R lub S jest następnie przypisywana w zależności od orientacji przestrzennej uszeregowanych podstawników. Chociaż jest to głównie używane w przypadku asymetrycznych atomów węgla, dotyczy to innych stereocentrów z czterema podstawnikami.

Jednak atomy azotu i fosforu mogą również działać jako stereocentry, jeśli odwrócenie ich konfiguracji jest zablokowane (np. są w cząsteczce cyklicznej) lub wystarczająco spowolnione (np. z powodu dużych podstawników). Najwyraźniej te stereocentra są również oznaczone w sposób R / S. Przykłady, które znalazłem, obejmują podstawę Trögera:

Tröger's base

(powyżej enancjomer (5S, 11S), poniżej (5R, 11R) ) -enancjomer) i DIPAMP:

DIPAMP


Powiedziawszy to, nie mogę znaleźć żadnego odniesienia do tego, jak Schemat nazewnictwa R / S jest stosowany do tych czworościennych stereocentrów, które nie mają czterech podstawników, ale zamiast tego wolną parę elektronów i trzy podstawniki. Zakładam, że ten sam schemat można zastosować, jeśli weźmie się pod uwagę samotną parę jako podstawnik o najniższej randze, ale nie mogę znaleźć żadnego kanonicznego odniesienia do tego.

Jak więc nazywa się takie stereocentra? Jakie autorytatywne odniesienia mogę znaleźć na ten temat?

Zwróć uwagę, że nie musi to być „niewęglowe”. Karbany również są chiralne, ale nie sądzę, by kiedykolwiek trzeba było nazywać je _nazwą_
Teraz zastanawiam się, jakie są zasady dotyczące jonowego związku organicznego (np. Karboanionu z wiązaniem jonowym z $ \ ce {K +} $)
Jeden odpowiedź:
ManishEarth
2012-05-18 16:53:36 UTC
view on stackexchange narkive permalink

ale nie mogę znaleźć żadnego kanonicznego odniesienia na ten temat.

Przyjrzyj się uważniej ;-)

To wygląda na to, że samotna para ma najniższy priorytet.

OK, nie mogę znaleźć żadnego autorytatywnego odniesienia do tego (nie mam dostępu do oryginalny artykuł), ale mam wiele innych:

W porządku, IUPAC mówi:

Z wyjątkiem wodoru, ligancję, jeśli nie cztery, można zwiększyć do czterech, dodając „atomy fantomowe”, które mają liczbę atomową zero (0) i dlatego są zawsze ostatnie w kolejności.

To ma różne zastosowania, ale chyba najbardziej interesujące jest to, że azot występuje w sztywnym szkielecie, jak na przykład a-izosparteina (14); tutaj atom fantomu można umieścić tam, gdzie znajduje się samotna para elektronów azotu; wtedy N-i pojawia się, jak pokazano obok wzoru, a chiraiity (R) jest konsekwencją; to samo dotyczy N-i6. Atomy fantomowe są podobnie używane podczas przypisywania symboli chiralności do chiralnych sulfotlenków (patrz przykład do reguły E - 4.9).

Gdy ligancja jest mniejsza niż cztery, oczywiście mamy kilka samotnych par kręcących się w pobliżu (z wyjątkiem w wodorze - który został wykluczony i w niektórych innych przypadkach, takich jak karbokationy - które i tak są płaskie)

A więc samotna para staje się „atomem fantomu” i ma priorytet 0.

Teraz zastanawiam się, co się stanie z tymi regułami, jeśli masz dwie samotne pary, w tym jedną mionową ;-)

Sprawdź pierwsza wersja tego postu dla moich oryginalnych, nieautorytatywnych odniesień

„Atomy fantomowe są podobnie używane przy przypisywaniu symboli chiralności do chiralnych sulfotlenków” - szczególnie znanym przykładem jest inhibitor pompy protonowej * (S) * - omeprazol (esomeprazol, Nexium), którego jedynym centrum chiralności jest siarka sulfotlenkowa. Tak więc, dla centrów chiralnych, które są piramidalne, odwróć samotną parę od siebie i sprawdź, czy kolejność zgodna z ruchem wskazówek zegara / przeciwna do ruchu wskazówek zegara z pozostałych trzech wisiorków.


To pytanie i odpowiedź zostało automatycznie przetłumaczone z języka angielskiego.Oryginalna treść jest dostępna na stackexchange, za co dziękujemy za licencję cc by-sa 3.0, w ramach której jest rozpowszechniana.
Loading...